Table 5: Number of codons per thousand in yeast genes and Ty elements
 

Amino acid Codon   tRNA tRNA tRNA tRNA  

HIGH

/1000

LOW

/1000

ALL

/1000

 

Ty1A

Ty1B

Ty2A

Ty2B

Ty3A

Ty3B

Ty4A

Ty4B

Phe TTT   Phe        

8.58

26.12

27.07

 

25.00

19.37

15.98

16.95

13.79

21.98

19.32

17.19

Phe TTC   Phe        

28.79

17.62

18.41

 

6.82

10.26

9.13

10.73

37.93

19.39

12.08

10.54

Leu TTA   Leu1 Leu3 Leu4    

13.53

18.90

26.55

 

18.18

25.07

25.11

29.38

20.69

29.09

38.65

32.72

Leu TTG   Leu1 Leu3 Leu4    

54.44

21.28

26.93

 

11.36

13.11

6.85

11.30

6.90

7.11

19.32

13.87

Leu CTT   Leu1     Leu5 ?  

1.82

17.19

12.69

 

9.09

17.66

18.26

16.38

17.24

13.57

9.66

5.55

Leu CTC   Leu1     Leu5   

0.27

11.66

5.68

 

6.82

5.70

2.28

5.08

6.90

13.57

7.25

3.88

Leu CTA   Leu1        

6.18

14.49

13.62

 

11.36

15.38

13.70

17.51

10.34

18.75

19.32

15.53

Leu CTG         Leu1   

0.66

20.07

10.85

 

2.27

6.27

4.57

6.21

10.34

9.70

0.00

6.10

Ile ATT   Ile2        

28.42

21.55

30.31

 

27.27

25.64

18.26

27.68

13.79

22.62

41.06

44.93

Ile ATC   Ile2        

30.23

15.58

16.86

 

11.36

20.51

22.83

15.25

27.59

23.92

21.74

16.08

Ile ATA     Ile1      

0.73

24.00

18.52

 

11.36

25.64

9.13

28.81

24.14

24.56

21.74

29.95

Met ATG   Meti Met3      

19.10

24.54

20.93

 

29.55

18.80

22.83

17.51

37.93

18.75

21.74

19.97

Val GTT   Val1a Val1b      

42.49

13.80

21.61

 

18.18

14.81

20.55

15.25

0.00

13.57

24.15

14.98

Val GTC   Val1a Val1b      

31.16

9.79

11.19

 

6.82

7.41

11.42

9.60

6.90

14.87

14.49

9.43

Val GTA     Val1b Val2a    

1.12

17.35

12.20

 

13.64

17.09

6.85

10.73

10.34

18.75

12.08

17.19

Val GTG       Val2a ? Val2b  

1.98

18.65

11.06

 

0.00

2.28

6.85

3.95

3.45

3.23

9.66

9.43

Ser TCT   Ser2        

34.92

16.40

23.53

 

34.09

24.50

27.40

24.29

27.59

10.34

14.49

17.75

Ser TCC   Ser2        

22.48

11.94

14.16

 

25.00

17.09

18.26

10.73

6.90

14.87

7.25

6.66

Ser TCA       Ser4    

3.51

19.28

19.11

 

29.55

30.77

34.25

26.55

6.90

14.87

14.49

24.96

Ser TCG         Ser5  

0.49

14.34

8.90

 

9.09

7.98

2.28

9.04

3.45

3.23

4.83

2.77

Pro CCT   Pro1        

4.74

13.87

13.42

 

25.00

21.65

15.98

16.95

3.45

12.93

14.49

9.98

Pro CCC   Pro1        

0.43

10.77

6.95

 

11.36

7.98

0.00

6.78

3.45

13.57

0.00

2.22

Pro CCA     Pro2      

35.36

15.77

17.51

 

34.09

21.65

41.10

23.73

41.38

27.15

14.49

16.08

Pro CCG     Pro2 ?      

0.09

11.25

5.36

 

22.73

11.40

13.70

7.34

6.90

7.11

0.00

3.33

Thr ACT   Thr1        

31.79

14.00

19.92

 

27.27

26.21

20.55

21.47

13.79

14.22

16.91

21.63

Thr ACC   Thr1        

27.10

11.71

12.33

 

18.18

18.80

6.85

11.86

20.69

27.15

16.91

12.20

Thr ACA       Thr3    

3.02

20.02

17.91

 

38.64

25.64

36.53

32.77

27.59

25.86

26.57

27.18

Thr ACG         Thr2  

0.24

14.08

8.28

 

4.55

5.13

13.70

10.73

3.45

7.76

4.83

4.99

Ala GCT   Ala1        

66.28

13.64

19.92

 

22.73

15.95

29.68

19.21

24.14

15.51

9.66

10.54

Ala GCC   Ala1        

26.04

12.78

12.22

 

11.36

6.27

11.42

7.34

13.79

17.45

0.00

3.88

Ala GCA     Ala2      

3.57

19.34

16.36

 

20.45

21.65

11.42

16.95

10.34

18.10

12.08

12.20

Ala GCG     Ala2 ?      

0.38

13.65

6.35

 

0.00

1.71

4.57

1.69

3.45

4.52

4.83

2.77

Tyr TAT   Tyr        

4.58

17.21

19.08

 

20.45

25.07

29.68

28.81

24.14

18.10

19.32

22.19

Tyr TAC   Tyr        

26.29

14.44

14.35

 

15.91

17.09

20.55

18.08

17.24

25.21

9.66

16.64

End TAA   --        

3.34

1.91

0.00

 

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

End TAG   --        

0.60

1.32

0.00

 

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

His CAT   His2        

5.36

13.72

13.77

 

27.27

22.22

25.11

21.47

20.69

14.22

12.08

17.75

His CAC   His2        

13.14

10.26

7.62

 

9.09

13.68

15.98

14.69

6.90

14.87

2.42

8.87

Gln CAA   Gln1        

33.48

21.25

26.57

 

56.82

35.33

61.64

37.85

27.59

30.38

43.48

22.74

Gln CAG   Gln1?     Gln2  

0.77

20.89

12.37

 

18.18

10.83

13.70

10.17

13.79

12.93

12.08

8.87

Asn AAT   Asn        

6.24

27.11

36.42

 

50.00

41.03

54.79

42.94

44.83

27.15

55.56

55.46

Asn AAC   Asn        

33.45

22.07

24.42

 

22.73

25.64

29.68

32.77

34.48

30.38

24.15

31.61

Lys AAA   Lys1        

16.41

32.07

42.50

 

36.36

52.42

41.10

51.98

37.93

48.48

65.22

75.43

Lys AAG     Lys2      

68.48

26.01

30.29

 

11.36

18.80

15.98

21.47

17.24

21.98

28.99

26.07

Asp GAT   Asp        

21.48

23.65

37.96

 

27.27

30.77

25.11

39.55

24.14

26.50

50.72

48.25

Asp GAC   Asp        

27.90

19.28

19.98

 

20.45

28.49

18.26

25.99

31.03

31.67

19.32

20.52

Glu GAA   Glu3        

58.87

27.63

45.58

 

25.00

37.04

43.38

40.11

55.17

47.83

67.63

59.35

Glu GAG       Glu4    

4.06

23.64

19.67

 

13.64

13.11

6.85

10.17

13.79

10.34

16.91

13.31

Cys TGT   Cys        

7.62

8.90

8.21

 

9.09

6.27

6.85

3.95

10.34

7.11

7.25

7.21

Cys TGC   Cys        

0.87

9.42

5.02

 

2.27

3.42

0.00

4.52

10.34

5.82

19.32

7.76

End TGA   --        

0.22

1.63

0.00

 

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

0.00

Trp TGG   Trp        

9.22

12.14

10.53

 

6.82

7.98

9.13

8.47

10.34

7.11

2.42

4.99

Arg CGT     Arg2      

8.68

6.99

6.21

 

6.82

9.69

6.85

9.60

10.34

9.05

4.83

3.33

Arg CGC     Arg2      

0.17

8.34

2.69

 

4.55

2.85

2.28

2.26

3.45

6.46

0.00

1.66

Arg CGA     Arg2 ?   Arg4 ?  

0.03

7.45

3.13

 

2.27

6.84

0.00

6.78

10.34

11.64

2.42

3.88

Arg CGG         Arg4  

0.00

6.41

1.88

 

2.27

1.14

0.00

0.00

3.45

0.65

2.42

1.66

Ser AGT   Ser3        

2.75

15.28

14.64

 

6.82

15.38

13.70

14.69

6.90

9.70

7.25

17.75

Ser AGC   Ser3        

2.37

14.01

10.15

 

4.55

5.70

11.42

7.34

3.45

5.82

4.83

5.55

Arg AGA   Arg3        

43.55

15.18

20.79

 

15.91

19.37

18.26

20.34

44.83

29.73

21.74

26.62

Arg AGG   Arg1        

0.70

12.58

9.64

 

6.82

2.85

6.85

2.82

10.34

4.52

16.91

7.76

Gly GGT   Gly1        

65.07

13.72

22.35

 

9.09

15.95

11.42

18.64

13.79

11.64

14.49

10.54

Gly GGC   Gly1        

3.16

14.43

9.90

 

9.09

8.55

2.28

5.65

0.00

3.23

0.00

4.99

Gly GGA     Gly2      

0.90

15.36

11.28

 

9.09

11.40

4.57

8.47

27.59

19.39

9.66

17.75

Gly GGG       Gly3    

0.28

10.26

6.24

 

6.82

1.71

2.28

0.56

0.00

0.00

4.83

4.99